Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDR1Q08345 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms