Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
REG3AQ06141 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms