Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
POU3F1Q03052 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms