Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVFC1P60507 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms