Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ME1P48163 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ME1P48163 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ME1P48163 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ME1P48163 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms