Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NSG1P42857 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NSG1P42857 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NSG1P42857 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms