Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CASQ1P31415 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CASQ1P31415 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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