Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CRABP1P29762 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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