Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSFA2P28290 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSFA2P28290 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms