Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB4P28070 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMB4P28070 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMB4P28070 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms