Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC175P0C221 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms