Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms