Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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