Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GOLGA6L4A6NEF3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms