Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRD1A4D1F6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRD1A4D1F6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms