Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM30AQ9NV96 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms