Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PCNX1Q96RV3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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