Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF182Q8N6D2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF182Q8N6D2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF182Q8N6D2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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