Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms