Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMNTD2Q8IXW0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms