Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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