Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
CSAG1Q6PB30 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms