Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC38Q502W7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms