Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FHOD3Q2V2M9 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FHOD3Q2V2M9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms