Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SYCP1Q15431 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SYCP1Q15431 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms