Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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