Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
EGR3Q06889 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms