Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PSME1Q06323 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms