Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GTF2BQ00403 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms