Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP2P78314 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2P78314 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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