Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFNP31947 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFNP31947 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms