Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms