Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMIGD3P0DMS9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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