Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PMPCBO75439 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PMPCBO75439 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PMPCBO75439 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms