Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ASIC3Q9UHC3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms