Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCSER1Q9C0I3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCSER1Q9C0I3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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