Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BCO2Q9BYV7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms