Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KATNB1Q9BVA0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms