Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
TXNDC17Q9BRA2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms