Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC114Q96M63 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms