Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF34Q969K3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms