Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms