Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KLHL22Q53GT1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms