Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GRIK4Q16099 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GRIK4Q16099 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms