Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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