Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEDD8Q15843 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEDD8Q15843 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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