Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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COL4A6Q14031 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COL4A6Q14031 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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