Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CALCOCO2Q13137 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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CALCOCO2Q13137 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CALCOCO2Q13137 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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