Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTRA4P83105 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms