Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNA2P51530 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms